El Estudio de Impacto Ambiental (EIA) del proyecto Conga contiene un plan de trabajo sobre las lagunas Azul y Chica. En la primera se depositará desmonte, que es material estéril, sin contenido de mineral. En la segunda se prevé colocar los relaves, masa que ha sido tratada químicamente para extraer el metal. Es decir, las lagunas Azul y Chica serán trasvasadas para convertirlas en botaderos de Minas Conga durante 19 años, tiempo que durará la explotación minera.Con este hecho no solo se modificará el paisaje sino también se destruirá la vida acuática de las lagunas. El propio documento señala que "la presencia de infraestructura en las distintas cuencas, en particular la del tajo abierto y de los depósitos de desmonte, generará modificaciones en el paisaje. Dichas modificaciones se visualizarán desde las cinco cuencas evaluadas, siendo las instalaciones más perceptibles el depósito de relaves, los tajos y los depósitos de desmonte".En cuanto a la vida acuática admite que en esas lagunas se registraron un promedio de nueve especies "siendo los valores más altos para las lagunas Azul y Perol".