En contra de su voluntad, el juez Jorge Barreto tuvo que admitir la presentación al proceso contra Rómulo León Alegría y Alberto Químper los informes de la Contraloría General de la República que señalan irregularidades en la licitación y la buena pro de cinco lotes petroleros a favor de Discover Petroleum International.El 13 de mayo del 2009, a pedido de los abogados defensores, Barreto descartó el uso de dichos informes, pero hace una semana la 3ª Sala Penal Anticorrupción le enmendó la plana y ordenó admitirlos como prueba.La Sala Superior consideró que no existen motivos para que la Contraloría no sustente esos informes. Barreto rechazó la sustentación de los informes sin ningún argumento, salvo la oposición de los acusados que consideraron que la Contraloría había realizado una indebida investigación paralela.