La Confederación Internacional de Derechos Humanos (CIDH) concluyó en su informe que la causa principal para que se produjeran los acontecimientos del 5 de junio fue el incumplimiento, por el Estado peruano, del Convenio 169 de la Organización Internacional del Trabajo, así como de otros derechos constitucionales que fueron avasallados o desvirtuados con la intención de reinsertar al Perú en la economía globalizada.Soraya Gutiérrez Argüello, vicepresidenta de la CIDH, manifestó que más allá de las responsabilidades individuales que se puedan establecer, existen responsabilidades políticas por un conflicto que no empezó en Bagua, sino que viene de mucho tiempo atrás.