Según la investigación fiscal, la mayor parte del material sustraído del archivo del Ministerio de Salud corresponde a documentación de la Oficina General de Administración (OGA) del portafolio y el desaparecido Programa de Administración de Gestión (PAAG), que manejaba grandes recursos, pues tenía a su cargo la contratación del personal médico.También se sustrajeron documentos referidos al Programa de Apoyo a la Reforma de Salud (Parsalud). Se supo que incluso 50 cajas con estos papeles fueron las primeras en ser sustraídas.