La capacidad de gestión de los gobiernos regionales viene siendo cuestionada desde hace algún tiempo. Sin embargo, un informe del grupo Propuesta Ciudadana-Vigila Perú revela que, entre los años 2003 y 2006, estos triplicaron su nivel de inversiones: de S/.493 millones a S/.1,496 millones. Pese a ello, hay grandes diferencias en la capacidad de gasto en los 24 departamentos del país. Están los que aumentaron su capacidad de gasto, como Cajamarca, Lambayeque y Moquegua; mientras que Puno y Madre de Dios gastaron en inversiones menos que en 2003.