La trayectoria política de Alberto Otárola está estrechamente vinculada al sector de la Defensa desde enero del 2002 a abril 2003 en que fue asesor del Ministerio de Defensa para el proceso de reestructuración de esta cartera y la reforma de las Fuerzas Armadas en el gobierno de Alejandro Toledo. En la gestión del expresidente Ollanta Humala reaparecería como titular de Defensa entre diciembre del 2011 a mayo del 2012.Ya en el Gobierno de Dina Boluarte dio un salto con garrocha cuando de abogado de esta pasaría a ser su ministro de Defensa, para al poco tiempo convertirse en su jefe de gabinete.