El uso y abuso de las exoneraciones en los procesos de concursos públicos y licitaciones aprobadas por diversas entidades estatales generó que la Contraloría denunciara civil y penalmente ante el Ministerio Público a trece entidades que, entre los años 2003 y 2004, habrían manejado irregularmente la suma de S/. 9'319.000. El presunto manejo delictivo de dichos fondos públicos involucra a instituciones de diversos estamentos del Estado. En el caso de los gobiernos locales, la corrupción habría estado presente en los concejos de Tacna, Piura, Sechura, Talara-Pariñas, Puno, Maynas (Iquitos) y San Juan de Miraflores.En cuanto a los gobiernos regionales, la Contraloría detectó indicios de corrupción en la administración de Huánuco. También en la zona franca de Tacna. Respecto a entidades dependientes del Poder Ejecutivo, fueron denunciados el Consejo Nacional de Tasaciones (Conata), del Ministerio de Vivienda; la Comisión para la Promoción de Exportaciones (Prómpex), del ministerio de Comercio Exterior y Turismo; y el Instituto Nacional de Investigación y Extensión Agraria (INIA) y el Consejo Nacional de Camélidos Sudamericanos (Conacs), ambos organismos del Ministerio de Agricultura.