La Oficina Nacional de Procesos Electorales (ONPE) exoneró del uso de la tinta indeleble a los votantes de las zonas declaradas en estado de emergencia, en aras de garantizar su seguridad ante cualquier amenaza. Debe recordarse que los grupos terroristas amenazaron con asesinar o agredir a los ciudadanos si es que éstos acudían a las urnas a cumplir con su deber cívico. Una de las formas de identificar a quienes lo hacían era la mancha de tinta indeleble en uno de los dedos de la mano. La Resolución Jefatural Nº 060-2006 de la ONPE indica que dicha medida se aplica "a fin de llevar a cabo un proceso electoral provisto de las garantías de seguridad necesarias para lograr el voto consciente de los electores residentes en estos lugares y minimizar los riesgos".