La polémica persiste, inclusive dentro del propio gobierno. El Ministerio de Comercio Exterior y Turismo (Mincetur) se expresó en contra del decreto 1147 que "militariza" la administración de los puertos.En un documento enviado a la congresista Luciana León, el Mincetur refiere que la norma afectará las actividades comerciales pues faculta a la Marina de Guerra a controlar el tráfico de naves y mercancías, decidir el cierre de puertos, otorgar permisos para constituir nuevos terminales, entre otras funciones que antes correspondían a la Autoridad Portuaria Nacional (APN).